Историята на терапията с цветни есенции е свързана с живота и делото на нейния откривател д-р Едуард Бах (1886-1936), както и с хилядите му знайни и незнайни последователи по целия свят.

След като класифицира човешките личностни характеристики в седем основни групи, съответстващи на откритите от него седем нозоди, д-р Бах започва да търси природни агенти със съответното ниво на вибрации, които биха се справили с емоционалните предшественици на болестта. В резултат на задълбочените му знания в областта на ботаниката и интереса му към традиционните методи на народната медицина, той успява да открие и класифицира 38 цветни есенции, повлияващи личностни модели на поведение, описани в неговите седем групи.

Едуард Бах правилно възприема, че връзката „болест-личност“ е последствие от дисфункционални енергетични модели във фините тела. Той смята, че болестта е отражение на дисхармонията между физическата личност и Душата. Тази дисхармония в Баховата терапия се разглежда като водеща и много по-важна от конкретния болестен процес. Едва след корекция на емоционалните фактори, пациентите получават помощ в засилване на тяхната физическа и ментална жизненост и така биват подпомогнати в елиминирането на всяка соматична (физическа) болест.

Д-р Бах открива ефектите на различните цветя чрез наблюдения върху начина, по който му влияят. Стремежът му е бил да създаде метод за приготвяне на вибрационни есенции без да се налага да стрива на прах растението и да го потенцира по времеотнемащия  хомеопатичен метод. Започва да събира роса от цветя, изложени на слънчева светлина и от същите такива, виреещи на сянка. Сравнявайки двете смеси, той установява, че водата от изложените на слънце цветя има по-силно изразен ефект. Така стига до извода, че фините ефекти на слънчевата светлина са от решаващо значение за зареждане на водата с енергетичния отпечатък от вибрационния подпис на растението.

Д-р Бах приготвя цветните есенции, използвайки 2 метода – на соларизация и чрез варене.

След неговата смърт, за известен период от време уникалният му метод на лечение потъва в забрава, за да преживее истински ренесанс след края на Втората световна война. Освен във Великобритания, производството на цветни есенции се разпространява в цяла Западна Европа, а по-късно се пренася на американския континент, в Азия  и  Австралия. Днес, в страните по цял свят  трудно може да бъде открит човек, загрижен за здравето си, който да не познава или да не е изпитал поне веднъж благотворното действие на цветните есенции.

Освен, че в различните натуропатични школи по света широко се използват цветните еликсири на д-р Бах, според емоционалните и ментални критерии, установени от самия него, така се провеждат и различни типове експерименти с други цветя. През 1979 година Ричард Кац основава Общество за цветни есенции (FES). Освен, че тази организация създава рамка за работещите с цветни есенции, чрез изследователската дейност на много цветотерапевти се въвеждат редица нови есенции. Калифорнийската школа включва 108 цветя, а в Австралия е известна и системата от 69 цветя на Буш.

Независимо от новите открития за целебния ефект на множество нови цветни есенции, класическата система от 38 цвята на д-р Бах си остава най-съвършена, може би защото е най-опростена и същевременно с това най-високоефективна и универсална.